El Proyecto Madrasa es un proyecto por el cual los niños saharauis que acaban su ciclo en el Proyecto Vacaciones en Paz (a los 12 años) pueden venir a estudiar a España, siendo acogidos por las familias en las que han pasado los últimos cuatro veranos.
En el Proyecto Madrasa los niños conviven con las familias españolas durante el curso escolar y vuelven a los campamentos de refugiados en el verano, en donde pasan los dos meses de vacaciones escolares en compañía de sus familias saharauis, para volver en septiembre de nuevo a España y continuar con sus estudios.
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